電子顯微鏡不能看到原子內(nèi)部的結(jié)構(gòu)。原子(atom)構(gòu)成化學(xué)元素的基本單元和化學(xué)變化中的*小微粒，即不能用普通的化學(xué)變化再分的微粒。電子顯微鏡可觀測到原子，但直接觀察原子內(nèi)部結(jié)構(gòu)（原子核及電子云）卻極為困難。
電子透鏡用來聚焦電子，是電子顯微鏡鏡筒中*重要的部件。一般使用的是磁透鏡，有時也有使用靜電透鏡的。它用一個對稱于鏡筒軸線的空間電場或磁場使電子軌跡 
向軸線彎曲形成聚焦，其作用與光學(xué)顯微鏡中的光學(xué)透鏡（凸透鏡）使光束聚焦的作用是一樣的。
電子顯微鏡的種類和用途：
電子顯微鏡按結(jié)構(gòu)和用途可分為透射式電子顯微鏡、掃描式電子顯微鏡、反射式電子顯微鏡和發(fā)射式電子顯微鏡等。
透射式電子顯微鏡常用于觀察那些用普通顯微鏡所不能分辨的細微物質(zhì)結(jié)構(gòu)；掃描式電子顯微鏡主要用于觀察固體表面的形貌，也能與X射線衍射儀或電子能譜儀相結(jié)合，構(gòu)成電子微探針，用于物質(zhì)成分分析；發(fā)射式電子顯微鏡用于自發(fā)射電子表面的研究。
